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生物信息学在人类基因组计划中的应用
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日期：2007-12-11 09:51:14
点击：59 评论：0
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| 生物信息学是当前生物学领域的研究热点，预计在未来的若干年它将变得越来越重要、越来越引起人们的重视。 近期任务 由于未来几年蛋白质和核酸的测序数据将以指数方式增加，近期生物信息学将在以下几方面迅速发展： 大规模基因组测序中的信息分析 大规模测序是基因组研究 |
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81种学术期刊
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日期：2007-12-02 14:23:56
点击：101 评论：0
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| 以下期刊网址： http://annualreviews.org/ 看文摘 1. Annual Review of Biochemistry 2. Annual Review of Biophysics Biomolecular Structure 3. Annual Review of Cell Developmental Biology 4. Annual Review of Genetics 5. Annual Review of Immunology 6. Annua |
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常用精品数据库
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日期：2007-12-02 14:22:32
点击：76 评论：0
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| 一、 中文数据库 1、 清华同方学术期刊网 中国最大的数据库，内容较全。收录了5000多种中文期刊，1994年以 来的数百万篇文章，并且目前正以每天数千篇的速度进行更新。阅读全文需在网站主页下载CAJ全文浏览器（3.7M）。 2、维谱全文数据库 文献收录1989年以来的全文。只 |
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免费检索数据库集（医药）
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日期：2007-12-02 14:20:13
点击：157 评论：0
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第五章 基因组信息分析
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日期：2007-03-29 08:11:19
点击：76 评论：0
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| 人类基因组计划的主要成果是得到一本“天书”，这本天书既简单又复杂。说它简单，是因为这本天书仅仅由 4 个字母构成，这 4 个字母分别是 A 、 T 、 C 、 G ；说它复杂，是因为这本天书包括所有人类生长发育的信息，隐含人类生老病死的规律。对于基因组序列，我们最关 |
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5.2 原核基因组特点
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日期：2007-03-29 08:10:14
点击：391 评论：0
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| 原核生物的遗传物质大都是环状 DNA ，它们基因组存在固有的特点，可以利用这些特点分辨物种，识别基因。 5.2.1 长开放阅读框 绝大部分原核生物蛋白质的长度大于 60 个氨基酸（在大肠杆菌 E.coli 中，蛋白质编码区域平均长度为 316.8 个密码子，不到 1.8% 的基因的长度 |
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5.3 真核基因组特点
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日期：2007-03-29 08:09:01
点击：537 评论：0
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| 真核生物基因组的规模远大于原核生物基因组， 真核基因具有复杂多变的结构，同时，真核基因具有复杂的表达调控方式。 5.3.1 基因组规模 真核细胞的细胞核中一般有多条线性染色体，而且通常包含每条染色体的双拷贝。 真核生物基因组比原核生物基因组要大得多。比如，人 |
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5.4 基因组序列分析
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日期：2007-03-29 08:07:39
点击：388 评论：0
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| 对于基因组 DNA 序列分析，除了进行序列比较之外，我们最关心的就是从序列之中找到基因及其表达调控信息。寻找基因牵涉到两个方面的工作：一是识别与基因相关的特殊序列信号，如启动子、起始密码子，通过信号识别大致确定基因所在的区域；二是预测基因的编码区域，或预 |
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5.5 基因识别方法
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日期：2007-03-29 07:56:41
点击：342 评论：0
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| 当人类基因组研究进入一个系统测序阶段时，急需可靠自动的基因组序列注释方法和技术，以处理大量已测定的但 未知 功能或未经注释的 DNA 序列，例如，将序列分为基因、启动子、转录调控区等。基因组注释的一个首要问题是找出所有的基因。对于基因组 DNA 序列中的基因识 |
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5.6 非编码区域分析和调控元件识别
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日期：2007-03-29 07:52:48
点击：187 评论：0
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| 基因非编码区的一个主要研究方向是对调控元件的研究。因为在转录和后转录水平，基因的表达在很大程度上受到一些顺式作用元件（即转录调控元件，在生物信息学中也称为模式或 motif ）的控制，它们本质上是一些比较短的 DNA 序列，这些序列一般都处在受调控基因的上游区 |
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第六章 系统发生分析
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日期：2007-03-29 07:50:47
点击：150 评论：0
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| 系统发生（或种系发生、系统发育， phylogeny ）是指生物形成或进化的历史。系统发生学 (phylogenetics) 研究物种之间的进化关系，其基本思想是比较物种的特征，并认为特征相似的物种在遗传学上接近。系统发生研究的结果往往以系统发生树（ phylogenetic tree ）表示， |
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6.2 基于距离的系统发生树构建方法
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日期：2007-03-29 07:47:45
点击：252 评论：0
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| 建立系统发生树的基本任务是：在给定的条件下（包括分类单元、分类单元的特征值或者序列），构造一棵最优的系统发生树。这里重点讨论针对 DNA 序列或者蛋白质序列构建系统发生树。 基于距离的系统发生树构建方法的基本思路是：给定一种序列之间距离的度量，在该距离度 |
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6.3 基于特征的系统发生树构建方法
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日期：2007-03-29 07:46:36
点击：243 评论：0
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| 基于特征的系统发生分析要解决的一般问题是：给定 n 个 分类单元 ， m 个用以描述 分类单元 的特征，以及每个 分类单元 所对应的特征值，构建一棵系统发生树，使得某个目标函数最大。输入一般为一个 n × m 的矩阵 M ，其中， M ij 代表第 i 个 分类单元 之第 j 个特征 |
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6.4 最大似然法
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日期：2007-03-29 07:45:32
点击：703 评论：0
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| 前面介绍的系统发生分析方法隐含地使用了各种概率模型，说明生物分子序列是如何进化的，通过系统发生树研究序列之间的进化关系。最大似然法 （ Maximum Likelihood ， ML ） 明确地使用概率模型，其目标是寻找能够以较高概率产生观察数据的系统发生树。最大似然法是一 |
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6.5 系统发生树的可靠性
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日期：2007-03-29 07:44:36
点击：177 评论：0
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| 在距离法中，连锁聚类方法比较简单，非加权分组平均法比较实用，当使用的距离数据是来源于多个基因的分析结果时，利用非加权分组平均法能得到可靠的系统发生树。对于离散特征分析方法，如果序列趋异程度较� ⒑塑账崽婊坏乃俾驶蚨嗷蛏俚暮愣ǎ畲蠹蛟挤ㄊ且恢纸虾玫南 |
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