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PCR设计引物时酶切位点的保护碱基表1
文章来源: 文章作者: 发布时间:2007-10-14   字体: [ ]  
 
关键词: PCR设计引物时酶切位点的保护                                          

不同内切酶对识别位点以外最少保护碱基数目的要求

不同内切酶对识别位点以外最少保护碱基数目的要求

寡核苷酸序列

切割率%

2 hr

20 hr

Acc I

GGTCGACC
CGGTCGACCG
CCGGTCGACCGG

0
0
0

0
0
0

Afl III

CACATGTG
CCACATGTGG
CCCACATGTGGG

0
>90
>90

0
>90
>90

Asc I

GGCGCGCC
AGGCGCGCCT
TTGGCGCGCCAA

>90
>90
>90

>90
>90
>90

Ava I

CCCCGGGG
CCCCCGGGGG
TCCCCCGGGGGA

50
>90
>90

>90
>90
>90

BamH I

CGGATCCG
CGGGATCCCG
CGCGGATCCGCG

10
>90
>90

25
>90
>90

Bgl II

CAGATCTG
GAAGATCTTC
GGAAGATCTTCC

0
75
25

0
>90
>90

BssH II

GGCGCGCC
AGGCGCGCCT
TTGGCGCGCCAA

0
0
50

0
0
>90

BstE II

GGGT(A/T)ACCC

0

10

BstX I

AACTGCAGAACCAATGCATTGG
AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA
CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT

0
25
25

0
50
>90

Cla I

CATCGATG
GATCGATC
CCATCGATGG
CCCATCGATGGG

0
0
>90
50

0
0
>90
50

EcoR I

GGAATTCC
CGGAATTCCG
CCGGAATTCCGG

>90
>90
>90

>90
>90
>90

Hae III

GGGGCCCC
AGCGGCCGCT
TTGCGGCCGCAA

>90
>90
>90

>90
>90
>90

Hind III

CAAGCTTG
CCAAGCTTGG
CCCAAGCTTGGG

0
0
10

0
0
75

Kpn I

GGGTACCC
GGGGTACCCC
CGGGGTACCCCG

0
>90
>90

0
>90
>90

Mlu I

GACGCGTC
CGACGCGTCG

0
25

0
50

Nco I

CCCATGGG
CATGCCATGGCATG

0
50

0
75

Nde I

CCATATGG
CCCATATGGG
CGCCATATGGCG
GGGTTTCATATGAAACCC
GGAATTCCATATGGAATTCC
GGGAATTCCATATGGAATTCCC

0
0
0
0
75
75

0
0
0
0
>90
>90

Nhe I

GGCTAGCC
CGGCTAGCCG
CTAGCTAGCTAG

0
10
10

0
25
50



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