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病毒RNA提取方法
文章来源: 文章作者: 发布时间:2007-11-07   字体: [ ]  
 

实验步骤:

1、 取200ul样品数+阴性对照+阳性对照个1.5ml灭菌eppendorf管。' @0 b' w# @( b% z: l9 P" k2 |

2、 加600ul异硫氰酸胍,然后加入对照和样品,再加200ul氯仿,颠倒混匀。

3、 13000rpm离心15min。

4、 在第3步离心快结束时,另取同样多eppendorf管,加入400ul -20度预冷的异丙醇。+ h; m/ e0 O: l5 }5 a  Y2 ]

5、 取第3步离心的上清(一定不要吸取到中间白色层,第3步离心结束往外拿的时候,管子尽量不要倾斜)转移到第4步准备的管中,颠倒混匀。9 V. h! d0 ~; N/ }2 r1 [2 @/ ~

6、 13000rpm离心15min,轻轻倒去上清;在吸水纸上尽量沾干液体。

7、 加600ul 75%乙醇,颠倒数次以洗涤残存异丙醇。& d& P6 }' F! ^% r$ K+ z) L

8、 13000rpm离心15min,轻轻倒去上清;在吸水纸上尽量沾干液体。

9、 4000rpm离心10s,将管壁残存液体甩到底部,用微量枪头吸干,室温干燥2-3min(不可过分干燥,防止下一步RNA不溶解)。8 T! h* G( O5 D

10、 加入20ul DEPE水(加入depc的纯水高压后的水即为DEPE水),轻轻混匀溶解RNA。2000rpm离心5s,冰上保存备用(最好2小时内使用,以免RNA降解)。

TRIzol LS提取:# k7 z6 Y/ g- e( J# T2 L2 q

所提取物为血清、血液、细胞培养液、鸡胚尿囊液等液体中的病毒。提取时尽量在人少时进行,防止空气中RNA酶的污染。所用一切物品也应是无RNA酶的。

实验步骤:

1、 在1.5ml的eppendorf管中加入病毒原液500ul,再加入TRIzol LS 500ul,充分混匀,室温放置10min。! E  Y$ ]1 R: X

2、 加入200ul的氯仿,盖紧离心管盖,用力震荡离心管(溶液充分乳化,成乳白状,无分相现象),室温放置10min (由于氯仿沸点低、易挥发,振荡时离心管可能爆开,小心)。

3、 离心 4℃、13000r/min、15min,取上层液相移入另一管(切忌吸动白色中间相)。

4、 加入等体积异丙醇,轻轻颠倒离心管充分混匀液体,室温放置10min。

5、 离心 4℃、13000r/min、15min,(这时乍一看会发现管子里好像没有东西,再仔细看看,会发现靠近管底的壁上有一星点的白色沉淀物,就是它了)用枪小心吸去所有上清。4 Y2 U* J" j  C6 G6 r

6、 1ml75%乙醇洗一遍,离心 4℃、8000r/min、10min,(这时又会发现管子没东西了,不要担心,有的,但是因为量太少看不见罢了)用枪小心吸去所有上清,在超净台中干燥5min。2 S( g2 ]  R, D  {/ x: H+ d& d

7、 加入适量DEPC处理水。(如果材料来源丰富的话,加入的水量为下一步RT的total减去其他试剂的量;若要省着点用,则自己看着办,尽量不要加太多的水)。

8、 建议立即做RT。若要保存,可在上一步加入乙醇后冻存于-70℃,可保存一年;若加入DEPC水后则只能在-20℃保存1个月左右。

Trizol提取法:& J5 e- ]8 F! N

Trizol法适用于人类、动物、植物、微生物的组织或培养细菌,样品量从几十毫克至几克。; q/ W. ^, a; }* D: d3 y

实验步骤:

1、 取病毒源液,加入5-10倍体积 Trizol液,混匀。

2、 室温放置5分钟,然后以每1ml Trizol液加入0.2ml的比例加入氯仿,盖紧离心管,用手剧烈摇荡离心管15秒。

3、 取上层水相于一新的离心管,按每ml Trizol液加0.5ml异丙醇的比例加入异丙醇,室温放置10分钟,12000g离心10分钟。! E: P5 G% f9 `$ d0 I

4、 弃去上清液,按每ml Trizol液加入至少1ml的比例加入75%乙醇,混匀,4℃下7500g离心5分钟。

5、 重复第4步。

6、 小心弃去上清液,然后室温干燥5-10分钟,注意不要干燥过分,否则会降低RNA的溶解度。

7、 然后将RNA溶于水中,放置10分钟。+ J" O  s( ?9 n$ w' ]/ k

注意事项:

1、 整个操作要带口罩及一次性手套,并尽可能在低温下操作。3 p0 X; v$ t8 ^7 V

2、 加氯仿前的匀浆液可在-70℃保存一个月以上,RNA沉淀在70%乙醇中可在4℃保存一周,-20℃保存一年。



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