对常规图谱分析的影响。能够确定单个精子的基因型对用家系法对常规基因图谱 进行分析具有重大的影响。当双亲的遗传标记的相位已知时，就可获取最大限度的有 关家庭研究的情况，而这方面的情况常常是无法获得的。

　　用单个精子的定型法，通过观察哪一类精子最多就能容易地确定父亲的相位。当 遗传标紧密连锁时，可确定非重组染色体，便也确定了标记的相位。

研究重组与物理间距之间的关系

　　能够对大量减数分裂产物分裂的另一大好处是将有可能对遗传标记在物理意义上非常靠近的重级频率进行精确的定位。结合大片段DNA和染色体凝胶电泳的方法，有可能测得精确物理距离已知的遗传标记之间的重组频率。这就能够对染色体特异区域的重组频率和物理距离之间的关系进行比较，这些特异区域的重组平均值是常规采用 的每百万个碱基对发生1％重组。

　　能够检测物理间距很短的重组将在重组热点垢研究方面特别有用。根据大量的不平衡连锁的数据，人的重组热点存在于β血红蛋白编码区域、胰岛素基因座以及免疫球蛋白的重链区域。染色体X和Y的假常染色体区域的重组率比1％／1000KB的平均重组率高出20倍。在一个长的DNA片段内通过家系分析来确定特殊的热点区域将是非常艰巨的任务。很明显，任何能够估计出小DNA片段之间可能发生重组的技术将对了解重组增强的分子机制提供有价值的资料，而且同时可能有助于对重组过程本身认识。

其它应用

　　由于有可能从单个个体中获取具有统计意义的重组频率数据，因此同时也应该能 够确定不同男性的相同染色体间隔的重组率是相同还是不同以及是否特定间隔的重组 率随年龄的变化而变化。从而能够为遗传学的研究提供有价值的资料。

　　不能够进行大量繁殖或繁殖周期很长的生物体，单个精子分型是构建这些生物体的遗体图谱唯一实际可行的方法。这或许对研究灵长类如黑猩猩等具有特别重要的意义，因为物理图谱和单精子重组的研究可能为我们提供有关重组进化的知识，以及由 重组而产生的变异在人类进化过程中所起的作用。

　　非精子单细胞DNA序列的研究使得有可能研究适涉到在DNA重排或其它遗传改变的 发育过程中细胞与细胞之间的变异，该方法同样具有一定的重要性。同样有可能对移 植前的体外受精胚单细胞进行产前诊断。