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MAPK信号通路研究工具
  日期:2007-07-30 23:10:44 点击:333 评论:0
信号通路研究工具 促细胞分裂原活化蛋白激酶(MAP kinase)是一类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,由于不同的细胞外刺激或介导细胞表面至细胞核的信号转导而被激活。 结合其它信号途径,它们能够改变转录因子的磷酸化状态。受控的MAPK级联反应系统参与细胞增殖和分化,但当其活力
蛋白质预测分析
  日期:2007-07-29 22:10:22 点击:417 评论:0
蛋白质预测分析 蛋白质预测分析: 物理性质预测 : Compute PI/MW http://expaxy.hcuge.ch/ch2d/pi-tool.html Peptidemass http://expaxy.hcuge.ch/sprot/peptide-mass.html TGREASE ftp://ftp.virginia.edu/pub/fasta/ SAPS http://ulrec3.unil.ch/software/SAPS_form
一些与蛋白质方面有关的名词解析
  日期:2007-07-29 22:03:42 点击:90 评论:0
一些与蛋白质方面有关的名词解析 1. 氨基酸(amino acid):是含有一个碱性氨基和一个酸性羧基的有机化合物,氨基一般连在α-碳上。是蛋白质的构件分子。 2. 必需氨基酸(essential amino acid):指人(或其它脊椎动物)(赖氨酸,苏氨酸等)自己不能合成,需要从食物
蛋白质相关实验技术操作全攻略
  日期:2007-07-29 21:48:59 点击:193 评论:0
蛋白质相关实验技术操作全攻略 1、Western blotting: Western blotting using ECL reagent used by:Laboratory of P.J. Hansen,Dept. of Animal Sciences, University of Florida Kamps's Western Blotting Protocol used by:Sefton Lab, Salk Institute Dry Transfe
Protein Precipitation Protocols
  日期:2007-04-01 09:48:16 点击:161 评论:0
TCA-DOC For precipitation of very low protein concentration 1) To one volume of protein solution, add 1/100 vol. of 2% DOC (Na deoxycholate, detergent). 2) Vortex and let sit for 30min at 4C. 3) Add 1/10 of Trichloroacetic acid (TCA) 100% vortex and
蛋白定量技术
  日期:2007-04-01 09:45:05 点击:144 评论:0
(一)双缩脲测定法 1.原理 蛋白 质中的肽键有双缩脲反应,在碱性溶液中与二价铜离子形成蓝紫色的络合物,在一定的范围内,颜色的深浅与 蛋白 质的含量成正比。此法特异性强,游离的氨基酸、小肽和核酸均不产生这种反应,但此法不够敏感,仅能测出毫克水平。 2.试剂
蛋白质提取与纯化技术
  日期:2007-04-01 09:37:48 点击:138 评论:0
选择材料及预处理 以蛋白质和结构与功能为基础,从分子水平上认识生命现象,已经成为现代 生物 学发展的主要方向,研究蛋白质,首先要得到高度纯化并具有 生物 活性的目的物质。蛋白质的制备工作涉及物理、化学和 生物 等各方面知识,但基本原理不外乎两方面。一是得用
附录 常用基本词汇表
  日期:2007-03-28 23:45:10 点击:135 评论:0
A 英 文 名 词 中 文 名 词 解 释 A ( Adenine ) 腺嘌呤 作为碱基的两种嘌呤中的一种。 active site 活化位点 蛋白质三维表面催化作用发生的区域。 alignment 比对 为了确定两个同源核酸或蛋白质序列的累计差异而进行的配对称为比对。 alignment of alignments 比对
第七章 蛋白质结构预测
  日期:2007-03-28 23:40:47 点击:212 评论:0
一种生物体的基因组规定了所有构成该生物体的蛋白质,基因规定了组成蛋白质的氨基酸序列。虽然蛋白质由氨基酸的线性序列组成,但是,它们只有折叠成特定的空间构象才能具有相应的活性和相应的生物学功能。 了解蛋白质的空间结构不仅有利于认识蛋白质的功能,也有利于认
7.2 蛋白质二级结构预测
  日期:2007-03-28 23:33:57 点击:392 评论:0
蛋白质的二级结构预测的基本依据是:每一段相邻的氨基酸残基具有形成一定二级结构的倾向。因此,进行二级结构预测需要通过统计和分析发现这些倾向或者规律,二级结构预测问题自然就成为模式分类和识别问题 。蛋白质二级结构的组成规律性比较强,所有蛋白质中约 85% 的
7.3 RNA二级结构的预测
  日期:2007-03-28 14:49:13 点击:379 评论:0
就核酸分子结构而言, DNA 具有双螺旋结构,而 RNA 是单链结构。单链 RNA 的三维结构是由它的核苷酸序列决定的,这与蛋白质的结构由蛋白质的序列决定相类似。但是, RNA 的结构并没有蛋白质的结构那么复杂。 RNA 的结构可以分为三个层次,即一级结构、二级结构和空间结
7.4 蛋白质空间结构预测
  日期:2007-03-28 14:46:55 点击:225 评论:0
生物信息学研究的一个主要目标是了解蛋白质序列与三维结构的关系,但是序列与结构之间的关系是非常复杂的。人们已经掌握了一些蛋白质序列与二级结构之间的关系,但是对于蛋白质序列与空间结构之间的关系了解得比较少。预测蛋白质的二级结构只是预测折叠蛋白的三维形状的
7.5 蛋白质空间结构比较
  日期:2007-03-28 14:44:46 点击:282 评论:0
对蛋白质的比较可以在序列水平上进行,也可以在结构水平上进行。前面已经介绍过在序列水平上的比较,通过序列比较,发现相似的蛋白质,发现氨基酸序列的保守模式。 蛋白质的结构比序列更加保守,通过比较蛋白质的空间结构,可以 发现蛋白质的结构共性, 发现属于同一家
6种方法测定蛋白质含量
  日期:2007-03-15 10:21:03 点击:426 评论:0
一、微量凯氏(kjeldahl)定氮法 样品与浓硫酸共热。含氮有机物即分解产生氨(消化),氨又与硫酸作用,变成硫酸氨。经强碱碱化使之分解放出氨,借蒸汽将氨蒸至酸液中,根据此酸液被中和的程度可计算得样品之氮含量。若以甘氨酸为例,其反应式如下: nh 2 ch 2 cooh+3h
表达蛋白的SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳分析
  日期:2007-03-15 10:03:29 点击:170 评论:0
一、原理 细菌体中含有大量蛋白质,具有不同的电荷和分子量。强阴离子去污剂SDS与某一还原剂并用,通过加热使蛋白质解离,大量的SDS结合蛋白质,使其带相同密度的负电荷,在聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)上,不同蛋白质的迁移率仅取决于分子量。采用考马斯亮兰快速染色,
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